Laboratori

Introducción a Fiji/Image J para el análisis de imagen de fluorescencia

150 €

COMPLETO

Descripció

La imagen digital se ha incorporado a la totalidad de equipos de microscopía óptica avanzada. Este tipo de imagen abre un amplio abanico de posibilidades a su manipulación para extraer la máxima información posible, tanto en el ámbito de investigación como en el asistencial, con el objetivo de obtener datos útiles y objetivos.

La extracción manual de parámetros implica un largo y tedioso tiempo de análisis y existe el sesgo debido a criterios subjetivos del investigador. Por esta razón, es necesario implicar en el análisis de imagen el uso de programas específicos que permitan identificar, aislar y analizar los elementos de interés de cada imagen para realizar su caracterización y, posteriormente, elaborar sistemas de automatización de análisis. En la actualidad existe una gran diversidad de programas profesionales que facilitan el tratamiento de imagen digital en el campo de la microscopía de fluorescencia y confocal, pero, a menudo, estos programas son costosos.

La aparición de software libre y abierto pone herramientas al alcance de todos. El software Fiji/Image J (Wayne Rasband, NIH, USA) es una herramienta cada vez más utilizada para el procesado y análisis de imágenes digitales obtenidas mediante la microscopía de fluorescencia y confocal. Gracias a esta tecnología se pueden conocer diferentes tipos de parámetros morfológicos y de cuantificación de fluorescencia, que utilizados correctamente posibilitan la obtención de información crucial para la interpretación de diferentes estudios científicos.

El propósito general de este curso online es familiarizar a los participantes en el uso básico del programa de procesado y de análisis de imágenes ImageJ/Fiji y proporcionar las estrategias necesarias para el procesamiento de imágenes de fluorescencia y confocal en sus investigaciones o ámbito de trabajo.

Dirigit a

  • Médicos/as.
  • Farmacéuticos/as.
  • Bioquímicos/as en ciencias de la salud.
  • Biólogos/as en ciencias de la salud.
  • Físicos/as en ciencias de la salud.
  • Químicos/as en ciencias de la salud.
  • Veterinarios/as.

Objectius

  • Mejorar la competencia de los profesionales y los investigadores en el campo del procesamiento y análisis de imágenes digitales obtenidas a partir de microscopios de fluorescencia y confocal. 

Continguts

  1. Unidad 1. Introducción a la imagen digital y herramientas básicas del Image J/FIJI.
    • Introducción a la imagen digital.
    • Práctica. Herramientas básicas del ImageJ: Instalación del programa, actualizaciones, plugins, ajustes de luminosidad, calibración de imágenes, tablas de color, separación/fusión de canales, anotaciones y ROIs.
    • Actividad práctica autodirigida.
  2. Unidad 2. Trabajar con series multidimensionales.
    • Práctica. Trabajando con series de 3D y 4D: manipulación de stacks, tipos de proyecciones y visualización, rendering, videos, anotaciones, ajuste y corrección de niveles de intensidad y mosaico.
    • Actividad práctica autodirigida.
    • Hands on con imágenes ejemplo.
  3. Unidad 3. Tratamiento de la imagen digital.
    • Tratamiento de imagen digital.
    • Práctica. Filtros y segmentación: manipulación del histograma, operaciones aritméticas sobre una imagen y entre imágenes, filtros matriciales y detectores de bordes.
    • Actividad práctica autodirigida.
  4.  Unidad 4. Cuantificación de fluorescencia y otras medidas.
    • Estudios de cuantificación de fluorescencia y otro tipo de medidas.
    • Práctica. Medidas y cuantificación de fluorescencia: histograma y segmentación, parámetros a cuantificar, medidas de intensidad en un área y un perfil, medidas múltiples, contador manual y analizador de partículas.
    • Actividad práctica autodirigida.
    • Hands on con imágenes ejemplo.

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Metodologia

Se realizarán dos hands-on en directo los días:

  • 26 de octubre: durante 1 hora en horario de 10 a 11h, 11 a 12h, 12 a 13h o de 13 a 14h.
  • 4 de noviembre: durante 1 hora en horario de 10 a 11h, 11 a 12h, 12 a 13h o de 13 a 14h.

Inscripcions

Precio: 150 € (hasta el 10/09/20: 140 €)

Con la colaboración:

     

Con el patrocinio:

Informació clau

Adreça Formación Hospital Sant Joan de Déu Barcelona | Plataforma virtual
21/10/2020 - 06/11/2020Descarregar programa
Laboratori
Idioma Espanyol
Hores lectives 16 h
Acreditació Solicitada la acreditación al Consell Català de Formació Continuada Professions Sanitàries-Comisión de Formación Continuada del Sistema Nacional de Salud